密歇根年夜学安娜堡分校的微生物体系生物学家Paul Jensen想看看人工智能（AI）东西，比方年夜言语模子是否统计差别微生物的研讨结果，他找到了他的试验室研讨的一种细菌——一种会招致龋齿的Streptococcus sobrinus的全体论文，却发明统共也就十多少篇，他曾经全体看过。很多微生物学家也面对着相似的处境，乃至更遭。上周，Jensen在bioRxiv上颁布了一项研讨，发明仅仅十种菌种就占了全部论文的一半，而近四分之三的已定名的细菌乃至不一篇专门的研讨文献。“咱们只具体研讨了多数多少种细菌。”Jensen表现，“但对更多细菌来说，年夜言语模子某人工智能却不任何懂得，”尤其是对人类跟地球安康至关主要的微生物，现在研讨有所完善。像其余性命迷信家一样，微生物学家也研讨形式生物，盼望从年夜肠杆菌如许被充足研讨的试验室“骄子”中取得可能实用于其余生物的看法，在很多情形下确切如斯：分子生物学的基本是树立在年夜肠杆菌试验之上的，但跟着迷信家们对皮肤拭子、粪便或泥土样本停止测序，一直拓展微生物名录，发明差别平常的新看法的机遇也随之增添。为了量化微生物学对多数形式生物的“偏幸”，Jensen查阅了一个包括43409 种奇特细菌的数据库，并统计了美国当局经营的生物医学文献库PubMed傍边，在题目或择要中提到细菌称号的论文数目。不出不测，民众杆菌以超越31.2万篇论文名列榜首，占总数的21%，前十名中其余细菌分辨是人类病原体，比方金黄色葡萄球菌（一种机遇性沾染）、结核分枝杆菌跟幽门螺旋杆菌（一种可招致溃疡乃至癌症的胃部微生物）。但是，74%的已知细菌物种在任何论文的题目或择要中都不被说起。在从前的25年里，已知的全体细菌数目与被研讨细菌之间的差距也越来越年夜，局部起因是微生物组研讨对微生物停止了年夜范围测序。意年夜利特伦托年夜学微生物组迷信家Nicola Segata对研讨成果倍感懊丧，但并不觉得惊奇。除了一两个破例，安康人体微生物组中大批存在的微生物并不进入50种最佳研讨细菌名单，Segata等人发明的很多对人类安康至关主要的微生物乃至没被定名，更不必说研讨了。“这些物种另有很长的路要走，才干失掉应有的研讨程度。”Segata表现。德克萨斯年夜学奥斯汀分校的微生物生态学家Brett Baker指出，在大陆跟泥土等多种生态体系中发明的微生物也未失掉充足研讨，他说，“天然界中的重要生物都不在这个名单上，这是一个成绩。”研讨职员表现，改正细菌学的宣布偏向并非易事，但人类要想从微生物组研讨中获益，就必需如许做。此中一个挑衅是在试验室培育未被充足研讨的微生物。“年夜肠杆菌之以是风行，局部起因是它轻易成长，很多研讨得最好的微生物都存在这种特征。”Baker说。Jensen则悲观地以为，迷信家能够学会培养主要但研讨缺乏的微生物。在Baker看来，微生物学家能够从年夜天然中吸取灵感，研讨试验室制作的微生物混杂物，“这些货色每每不肯意本人生活。”别的，年夜范围的尽力也可能弥补空缺，开放迷信非营利构造的名目司理Shantal Al Habib表现，该小组“向翻新看齐”名目刚开端了一项耗资100万美元的任务，目标是描写1000种微生物在1000种差别前提下的成长特色，详细包含差别养分状态、氧气程度以及温度。该小组在加利福尼亚州旧金山的迷信名目担任人Pete Kelly弥补道，这些数据将收费供给给迷信家，辅助练习人工智能模子，进一步深刻懂得微生物。Jensen也加入了“向翻新看齐”名目，他以为，目标并不是让微生物学家废弃年夜肠杆菌等形式生物，转而研讨更独特的物种，而是“假如咱们持续以同样的方法研讨微生物学，那么咱们要花上一万年的时光才干很好地懂得全部差别的微生物。”相干论文信息：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.01.04.631297v1